方法:检索TCGA数据库中有关PAAD的表达谱芯片RNA-seq Level-3数据,通过Perl程序语言、R软件中的edger包

方法:检索TCGA数据库中有关PAAD的表达谱芯片RNA-seq Level-3数据,通过Perl程序语言、R软件中的edger包筛选具有显著表达差异的基因(DEGs);利用基因表达谱在线分析平台GEPIA分析SSBP1在人体多种肿瘤组织和正常组织中的表达差异,并通过Ocomine、GEPIA对比分析PAAD组织与正常组织中Sphosphatase ���Ƽ� librarySBP1在mRNA水平的表达差异;基于STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI)并通过Cytoscape软件筛选核心基因(Hub Gene)后运用DAVID数据库进行GO功能注释和KEGG富集分析;最后,结合R2平台与GEPIA分析SSBP1、NIP7、PRPF3、INTS3等核心基因的表达与PAASelleckD患者生存预后的关系。结果:TCGA数据库分析发现,PAAD组织中共有777个DEGs,其中含26个表达上调基因、751个表达下调基因;Oncomine、GEPIA及R2研究显示,PAAD组织中SSBP1 mRNA的表达水平较正常组织均明显升高(P<0.05),且高表达组患者预后更差,差异具有统计学意PKC412分子量义(R2 P=0.046, GEPIA P=0.001 9)。结论:SSBP1在PAAD中显著高表达且提示预后不良,有望成为PAAD患者早期诊断、治疗及判断预后的分子靶标。
针对目前甘蓝型油菜Pol CMS、新型萝卜胞质Ogu CMS、新型甘蓝型油菜CMS鉴定过程中,存在必须从orf138、orf222、orf224 3种引物中选用2对引物进行分子标记互相验证鉴定的缺点。

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