利用简化基因组测序技术SLAF-seq,对广泛分布在长江以南地区8个省份的33份闽楠种质进行SNP标记开发、指纹图谱构建以及遗传多

利用简化基因组测序技术SLAF-seq,对广泛分布在长江以南地区8个省份的33份闽楠种质进行SNP标记开发、指纹图谱构建以及遗传多样性分析。本研究对各样品的测序数据进行统计,共获得107.52 Mb Clean Reads数据,每个样品的SNP标记数目介于309 012~540 030之间,样本平均测序质量值Q30为93.selleckchem78%,平均GC含量为40.90%。共获得1 072 115个SLAF标签,其中多态性SLAF标签275 389个。通过序列分析,获得121 352个有效的单核苷酸(SNP)多态性标记;经过指纹图谱严格的过滤条件,筛选出345 2个SNP位点作为指纹图谱SNP。利用开发的SNP分子标记,将33份闽楠种质资源3个AZD0156亚群,这3个亚群分别包含材料为Q1:17个,Q2:11个,Q3:5个。又通过进一步过滤,获得270个核心SNP标记作为指纹图谱的核心标记,可用于品种种质的鉴定。研究结果表明,简化基因组测序技术SLAF-seq能高效、低廉地开发出大量SNP标记,是一种适用于闽楠种质资源遗传分析的有效工具;利用筛选出的核心SNP分Selleck子标记构建闽楠DNA指纹图谱,为SNP分子标记应用于闽楠种质鉴定、闽楠品种改良与优质品种选育提供依据,也有利于闽楠种质的高效利用及杂种优势群的建立。
“第三次全国农作物种质资源普查与收集行动”浙江项目组从全省26个县(市, 区)收集到黑大豆地方种质资源累计34份。本研究对这34份黑大豆种质进行连续两年的田间种植鉴定,发现这些黑大豆材料在农艺性状、遗传变异及品质性状均存在丰富的变异。

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